1. 博士学位论文创新性不强，创新是博士学位论文的核心内容, 《中华人民共和国学位条例》规定, 博士学位获得者应在科学或专门技术上做出创造性的成果。然而, 有相当一部分的博士学位论文缺乏创新, 大致表现为以下几个方面:
有的博士论文理论与实践结合不够, 研究成果缺乏实验支持, 实用价值不高;有的论文对理论研究过于拘谨、简单, 缺乏进一步论证与深化研究;有的论文虽提出了新的方法与理论, 但可惜的是未对其进行全面、客观的评价, 特别是与其它方法的对比分析; “创新点” 太多。似乎整个学位论文都是创新点, 对于创新的理解太随意, “新” 与“旧” 不分, 创新性的“大” 与“小” 不分, “有意义” 与“无意义” 不分。有的论文其内容大多是导师的学术成果, 缺乏自己的创造;还有的论文甚至重复以往硕士研究生的内容与工作, 大同小异;论文作者在攻读博士学位期间, 发表与博士学位论文研究内容相关的学术论文数量少, 论文发表的学术刊物档次不高。
2.学位论文选题不恰当,一篇优秀的博士学位论文, 其选题应为学科前沿, 具有开创性。而有些博士学位论文则表现为选题不恰当, 题目不新, 选题缺乏前沿性、先进性与开拓性。一部分论文要么题目太大, 使研究无法进一步深入, 重点不明确;一部分论文则又选题过窄, 没有较大的理论意义与应用前景。
3.学位论文综述分析不足,博士学位论文的综述必须全面反映该学科及相关领域的发展和最新的研究成果, 归纳总结正确。而有些博士学位论文缺乏对国内外有关研究资料、研究背景的动态分析, 比较分析不够, 平淡性介绍多;有些博士学位论文综述不够系统, 综述部分归纳过于简单, 没有体现相应的学术水平;甚至有些博士学位论文综述与正文似乎毫无关系或者关系不大。
4.学位论文文体欠规范,博士学位论文既要有丰富的内容(学术上), 又要有良好的形式来支撑, 其外在质量对博士学位论文同样重要。学位论文的外在质量, 包括印刷、装帧, 以及论文的形式和格式等方面。很多博士学位论文在这方面都做得不够, 不少论文书写不够简练流畅, 或者参考文献、标注、图表不够规范, 或者文字表达不够准确, 或者文章中整体结构不够严谨, 或者英文摘要语法混乱, 词语翻译不准确, 甚至产生歧义。